Kegiatan Ekstrakurikuler yang sudah berjalan di MAN 2 Jakarta Timur antara lain:
1. Voli Kamis sore ( 16.00 – 17.30 )
2.Bulutangkis Selasa (15.30-17.00)
3. Silat senin sore (16.00 – 17.30)
4. Futsal Jumat sore ( 16.00 – 18.00 )
5. Basket Senin & Rabu Sore (16.00 – 18.00)
6. Pramuka Sabtu Pagi (08.00 – 12.00)
7. Jurnalistik Selasa Sore (16.00 – 17.00)
8. Saman Selasa – Rabu ( 16.00 – 17.00 )
9. Teater KAMIS SORE (16.00 – 17.00)
10. Rohis Sabtu pagi, Akhwat (08.00-10.00), Ikhwan (09.00-10.30)
11. Qira’at Selasa sore (16.00-17.00)
12. Taekwondo Kamis sore (16.00 – 17.30 )
13. Robotik Sabtu siang (13.00-15.00)
14.Marching band Kamis sore (16.00-17.00)
15. English Club Kamis sore (16.00 – 17.00)
16. Sispala Sabtu ( 10.00 – 13.00 )
17. PMR Kamis sore (16.00 – 17.00)
18. BAND Kamis sore (16.00 – 17.00)
19. Marawis Jumat (15.30 -17.00)
20. Hadroh Sabtu (09.00-11.00)
21. Arabic Kamis sore (16.00 – 17.00)
22. Tahfidz Kamis (15.30-17.00)
23. Paskibra Sabtu pagi (08.00 – 11.00)
24. TATRA Kamis – Jum’at (16.00 – 17.00)
25. KIR Jumat Sore ( 16.00 – 17.00)
