Kegiatan Ekstrakurikuler yang sudah berjalan di MAN 2 Jakarta Timur antara lain:

1. Voli  Kamis sore ( 16.00 – 17.30 )

2.Bulutangkis   Selasa (15.30-17.00)

3. Silat  senin sore (16.00 – 17.30)

4. Futsal  Jumat sore ( 16.00 – 18.00 )

5. Basket  Senin & Rabu Sore (16.00 – 18.00)

6. Pramuka  Sabtu Pagi (08.00 – 12.00)

7. Jurnalistik  Selasa Sore (16.00 – 17.00)

8. Saman  Selasa – Rabu ( 16.00 – 17.00 )

9. Teater  KAMIS SORE (16.00 – 17.00)

10. Rohis  Sabtu pagi, Akhwat (08.00-10.00), Ikhwan (09.00-10.30)

11. Qira’at  Selasa sore (16.00-17.00)

12. Taekwondo  Kamis sore (16.00 – 17.30 )

13. Robotik  Sabtu siang (13.00-15.00)

14.Marching band  Kamis sore (16.00-17.00)

15. English Club  Kamis sore (16.00 – 17.00)

16. Sispala  Sabtu  ( 10.00 – 13.00 )

17. PMR  Kamis sore (16.00 – 17.00)

18. BAND  Kamis sore (16.00 – 17.00)

19. Marawis  Jumat (15.30 -17.00)

20. Hadroh  Sabtu (09.00-11.00)

21. Arabic  Kamis sore (16.00 – 17.00)

22. Tahfidz  Kamis (15.30-17.00)

23. Paskibra  Sabtu pagi (08.00 – 11.00)

24. TATRA  Kamis – Jum’at (16.00 – 17.00)

25. KIR  Jumat Sore ( 16.00 – 17.00)